Студенты Академии
Академия — это место, где собираются потенциальные шиноби, которых фактически не считают ниндзя, пока те не дипломируются из школы. Ученики академии выдерживают теоретические и практические тесты всех типов, где изучаются основные навыки ниндзя: военное искусство, дзюцу, физическая выносливость и стиль жизни шиноби. Обычно им преподаётся использование основного оружия, такого как кунаи и сюрикены. Также преподаются различные элементарные техники, меняющиеся от деревни к деревне. Конечный экзамен академии меняется от школы к школе, в Селении Листвы он состоит из своего рода письменного теста и демонстрации фундаментальных техник. Единственным учеником, неспособным использовать чакру, когда-либо учившимся в Академии, был Рок Ли. После получения диплома выпускники получают налобную повязку («хитай-атэ») с металлической пластинкой, на которой изображен символ их селения. Некоторые, впрочем, носят её не на лбу, а, например, на руке или поясе. Кроме того, некоторые селения применяют дополнительный выпускной экзамен, который устраивает каждый сэнсэй-дзёнин своей команде из трёх учеников, чтобы проверить, действительно ли они готовы стать настоящими ниндзя и работать в команде. Таким образом гарантируется, что только поистине квалифицированные ниндзя получают звание гэнина. Эти экзамены разнятся в зависимости от учителя, который их проводит.
Генин
Генин обладает самыми низкими навыками ниндзя.Они обладают знанием всех основных навыков ниндзя и могут выполнять миссии низкого уровня c и d с их джонин сенсеями.Как только генины успешно выполнили 8 миссий их джонин сенсей может их готовить для экзамена на чунина.
Чунин
Чунин-основной квалифицированный ниндзя деревни.Эти ниндзя могут быть медиками или преподавателями.Они когда-то были генинами которые для показа на экзамене чунин продвигали привосходные сведения стратегий и боевых навыков.Чунины имеют эквивалентный разряд военного капитана,экпонируя сильную выдержку,знание и внутреннюю мудрость.
Специальный джонин
Специальный джонин-это ниндзя который приобрел высокие навыки джонина в одной области ниндзя искусств.Это такие ниндзя как Морино Ибики,который высококвалифицирован в допросе и пытке.Ниндзя достигают разряда специального джонина через оффициальное назначение.
Джонин
Джонин-это ниндзя который высококвалифицирован во всех навыках и искусствах дзюцу.Ниндзя достигают разряда джонин через официальное назначение.Джонин обычно служит командиром команды во время миссий.
Каге
Каге-самый сильный ниндзя скрытой деревни.Каге служит как опора на которой все деревенские стены,и отношение сил между деревнями ниндзя значительно зависит от силы Каге у власти.Каге имеют превосходную чакру и выдержку и знают множество дзюцу искусств.Толька пяти странам шиноби позваляеца обратится к своему главному ниндзя именем Каге.
АНБУ
Команда Особого Назначения АНБУ (яп. 暗部?, дословно «тёмная сторона») (аббревиатура от Ансацу Сэндзюцу Токусю Бутай (яп. 暗殺戦術特殊部隊 «Особая команда по тактике убийств»?) — особый отряд наёмных убийц, спецназ, находящийся под прямым контролем кагэ. Члены AНБУ носят фарфоровые маски, имеющие форму животных, для того, чтобы выделяться среди других шиноби и оставаться неузнанными. Также они имеют стандартную униформу, состоящую из чёрной и серой брони, защитных пластинок для рук и татуировки в виде спирали на левом плече, кроме того, они носят с собой ниндзя-то (меч ниндзя), который обычно прикрепляется к спине. Некоторые из них на стандартные униформы надевают чёрные плащи с капюшонами, в то время как лидер команды может носить плащ белого цвета. Все члены АНБУ прекрасно разбираются в анатомии человеческого тела, на основе чего были придуманы различные мощные техники, например дзюцу, парализующее противника. Одно из возможных её подразделений — это Ниндзя преследователи (яп. 追い忍 ойнин?), основная задача которого состоит прежде всего в поимке ниндзя-предателей, а затем в полном уничтожении их тел, таким образом избегая утечки в другие селения важной информации о типе чакры и различных анатомических признаках.
Ниндзя-медики
Ниндзя-медики (яп. 医療忍 ирё:нин?) специализируются в лечении, главным образом используя для этого медицинские дзюцу. Должность врача-ниндзя требует большого уровня знаний и превосходного контроля над чакрой, так как она используется при лечении различных повреждений. Кроме медицинского обучения они, для избежания вражеских атак, уделяют особое внимание изучению боевых навыков, состоящих главным образом из техник тайдзюцу и некоторых медицинских дзюцу. Главной причиной этому является то, что смерть санитара-ниндзя может привести к смерти всей команды. Обычно медики посылаются наряду с группой в опасные миссии, тем самым, увеличивая процент выживания той команды.
Для наиболее серьёзных повреждений ниндзя-медик выполняет Живительную технику реанимации (яп. 治活再生の術 Тикацу сайсэй но дзюцу?), которая использует частицы тела пострадавшего для регенерации клеток зоны повреждения. Дзюцу требует большого количества времени и концентрации, поэтому врачебный персонал, чтобы отдохнуть, периодически сменяется.
Иногда врачебное дзюцу может применяться и как оружие. Например Кабуто Якуси таким образом превращал поток сконцентрированной чакры в скальпель, которым разрывал мышцы и артерии. Помимо него в аниме присутствуют другие ниндзя-медики — в первую очередь Цунадэ, а также её ученицы: Сидзунэ, Сакура Харуно и Ино Яманака.
Ещё есть ниндзя-почтальоны, их задача доставить письмо, несмотря ни на что.
Ниндзя-предатели
Ниндзя-предатели (яп. 抜け忍 нукэнин?, «беглый ниндзя») — это те, кто покинул свою собственную деревню. За ними постоянно ведётся слежка из-за секретов, которые они хранят. Другие Скрытые Селения интересуются покупкой такой информации, потому, что это могло бы быть полезно для одержания победы в сражении или для заполучения уникального врождённого навыка определённого клана. Селения создают специальные подразделения Ниндзя-преследователей для предотвращения подобного развития событий, хотя маловероятно, что на каждого ниндзя-предателя имеется посланная за ним команда.